ビザ（査証）とビザ（在留資格）は意味合いが異なります。これは外務省と法務省という縦割り行政が関係しているとも言えます。

入管への手数料は、郵便局等で購入した「収入印紙」を手数料納付書に貼付して支払います。仙台入管の場合は、近くに郵便局がありますので、そちらを案内されるはずです（苦笑）